Las alergias son el resultado de un error del sistema inmunológico. A veces, su cuerpo piensa que una sustancia inofensiva es peligrosa y, en respuesta, lanza un ataque. Cuando se trata de colorantes alimentarios, algunos son realmente dañinos, pero no en la forma en que su sistema inmunológico cree que lo son. Las alergias a los colorantes alimentarios pueden afectar a niños y adultos, pero son raras en ambos casos. Los que tienen más probabilidades de causar problemas son el amarillo 5, el amarillo 6, el azul 1 y el rojo 40. Además, los rojos naturales que provienen del carmín, la cochinilla y el achiote también pueden causar reacciones alérgicas. Aunque tales alergias son muy poco probables, la posible reacción de anafilaxia las hace peligrosas para algunas personas.
Sin embargo, más allá de los riesgos de alergia, los colorantes alimentarios son dañinos por sus propiedades cancerígenas. Rojo 3, Rojo 40, Azul 1, Azul 2, Verde 3, Amarillo 5 y Amarillo 6 se han relacionado con el cáncer. Y según los estudios, algunos de los colorantes alimentarios provocan hiperactividad en los niños.